农业农村部公告 第864号-11-2024 转基因植物及其产品成分检测 耐除草剂玉米CC-2转化体特异性PCR方法

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资源简介

中华人民共和国国家标准《耐除草剂玉米CC-2转化体检测方法》主要内容总结


​一、标准概述​

  • ​标准编号​​:农业农村部公告第864号-11-2024
  • ​适用范围​​:适用于玉米及其制品中耐除草剂玉米CC-2转化体成分的定性和定量检测。
  • ​核心方法​​:提供三种PCR检测方法:
    1. ​实时荧光PCR定性检测(方法一)​
    2. ​实时荧光PCR定量检测(方法二)​
    3. ​普通PCR定性检测(方法三)​

​二、术语与定义​

  1. ​转化体特异性序列​​:外源插入片段与玉米基因组的连接区序列(5'或3'端),含玉米基因组及外源片段部分序列。
  2. ​阳性质控品​​:包括定性质控品(0.1%~1.0%转基因含量)和定量质控品(与标识阈值相当)。
  3. ​校准品​​:用于绘制标准曲线的梯度稀释样品,需含5个有效浓度。
  4. ​ΔCt值​​:转化体特异性序列与内标基因的Ct值差值;​​ΔΔCt值​​:试样ΔCt与阳性定量质控品ΔCt的差值。

​三、通用要求​

  • ​试剂与模板​​:三种方法可共用DNA提取试剂、引物/探针、质控品模板等。
  • ​抽样与试样制备​​:按农业部2031号公告和NY/T 672规定执行,需取3个子样独立检测。

​四、方法一:实时荧光PCR定性检测​

​1. 原理​

通过扩增玉米内标基因(zSSIIb)和CC-2转化体特异性序列,根据Ct值和ΔΔCt值判断是否存在目标成分。

​2. 关键参数​
  • ​引物/探针​​:
    • 内标基因zSSIIb(88 bp):引物zSSIIb-3F/4R,探针zSSIIb-P。
    • CC-2特异性序列(107 bp):引物CC-2-qF/qR,探针CC-2-qP(见附录A.1)。
  • ​扩增条件​​:95℃ 5min预变性;95℃ 15s + 60℃ 60s,40循环。
  • ​质控要求​​:
    • 阳性对照:Ct ≤ 36且典型扩增曲线。
    • 阴性/空白对照:无扩增或Ct > 36。
​3. 结果判定​
  • ​阳性​​:内标和CC-2序列均扩增(Ct ≤ 36)。
  • ​阴性​​:仅内标扩增,或内标未扩增(无玉米DNA)。
  • ​含量高低​​:ΔΔCt ≤ -0.4为“≥质控品”;ΔΔCt > 0.4为“<质控品”。
  • ​检出限(LOD)​​:0.05%(20拷贝/反应)。

​五、方法二:实时荧光PCR定量检测​

​1. 原理​

通过标准曲线计算转化体拷贝数与内标基因的比值,定量分析转基因含量。

​2. 关键参数​
  • ​校准品制备​​:纯合转化体DNA梯度稀释(涵盖5个浓度)。
  • ​标准曲线公式​​:Ct = a + b·lg(c),要求R² ≥ 0.98,斜率b为-3.1~-3.6。
  • ​定量计算​​:
    • 拷贝数比值 = (转化体拷贝数均值 / 内标基因拷贝数均值)× 100%。
    • 不确定度评定:联合验证数据预评定的标准不确定度(u0=0.0044,ur=0.0384)。
​3. 结果判定​
  • ​定量限(LOQ)​​:0.1%(40拷贝/反应)。
  • 定量结果表示为“C ± U”(C为均值,U为扩展不确定度)。

​六、方法三:普通PCR定性检测​

​1. 原理​

通过普通PCR扩增目标序列,电泳检测产物判断是否存在CC-2转化体。

​2. 关键参数​
  • ​引物​​:
    • 内标基因zSSIIb(151 bp):引物zSSIIb-1F/2R。
    • CC-2特异性序列(132 bp):引物CC-2-F/R(见附录A.2)。
  • ​扩增条件​​:94℃ 5min预变性;94℃ 30s + 58℃ 30s + 72℃ 30s,35循环;72℃延伸7min。
  • ​电泳检测​​:1%琼脂糖凝胶,溴化乙锭染色(建议用替代染料)。
​3. 结果判定​
  • ​阳性​​:内标和132 bp条带均出现。
  • ​阴性​​:仅内标或无条带。
  • ​检出限(LOD)​​:0.1%(40拷贝/反应)。

​七、附录A(关键序列)​

  • ​A.1实时荧光PCR扩增序列​​:107 bp片段,含玉米基因组(1-40)和外源插入序列(41-107)。
  • ​A.2普通PCR扩增序列​​:132 bp片段,含玉米基因组(1-91)和外源插入序列(92-132)。

​八、安全提示​

  • ​溴化乙锭(EB)​​:具致癌性,操作需戴手套,建议使用替代核酸染料。

​九、方法对比与适用场景​

​方法​ ​特点​ ​适用场景​
实时荧光定性 快速、灵敏,可初步定量 筛查是否存在转基因成分
实时荧光定量 精确测定转基因含量 需定量标识或阈值判定
普通PCR定性 成本低,需电泳验证 实验室基础检测或验证结果

​总结​​:本标准系统规范了耐除草剂玉米CC-2转化体的检测流程,涵盖定性与定量方法,强调质控、校准及结果判定的科学性,适用于市场监管、科研及进出口检验等领域。

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  • 本文由 发表于 2025年5月22日 15:14:24
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