农业农村部公告 第864号-11-2024 转基因植物及其产品成分检测 耐除草剂玉米CC-2转化体特异性PCR方法 ,该文件为pdf格式 ,请用户放心下载!
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资源简介
中华人民共和国国家标准《耐除草剂玉米CC-2转化体检测方法》主要内容总结
一、标准概述
- 标准编号:农业农村部公告第864号-11-2024
- 适用范围:适用于玉米及其制品中耐除草剂玉米CC-2转化体成分的定性和定量检测。
- 核心方法:提供三种PCR检测方法:
- 实时荧光PCR定性检测(方法一)
- 实时荧光PCR定量检测(方法二)
- 普通PCR定性检测(方法三)
二、术语与定义
- 转化体特异性序列:外源插入片段与玉米基因组的连接区序列(5'或3'端),含玉米基因组及外源片段部分序列。
- 阳性质控品:包括定性质控品(0.1%~1.0%转基因含量)和定量质控品(与标识阈值相当)。
- 校准品:用于绘制标准曲线的梯度稀释样品,需含5个有效浓度。
- ΔCt值:转化体特异性序列与内标基因的Ct值差值;ΔΔCt值:试样ΔCt与阳性定量质控品ΔCt的差值。
三、通用要求
- 试剂与模板:三种方法可共用DNA提取试剂、引物/探针、质控品模板等。
- 抽样与试样制备:按农业部2031号公告和NY/T 672规定执行,需取3个子样独立检测。
四、方法一:实时荧光PCR定性检测
1. 原理
通过扩增玉米内标基因(zSSIIb)和CC-2转化体特异性序列,根据Ct值和ΔΔCt值判断是否存在目标成分。
2. 关键参数
- 引物/探针:
- 内标基因zSSIIb(88 bp):引物zSSIIb-3F/4R,探针zSSIIb-P。
- CC-2特异性序列(107 bp):引物CC-2-qF/qR,探针CC-2-qP(见附录A.1)。
- 扩增条件:95℃ 5min预变性;95℃ 15s + 60℃ 60s,40循环。
- 质控要求:
- 阳性对照:Ct ≤ 36且典型扩增曲线。
- 阴性/空白对照:无扩增或Ct > 36。
3. 结果判定
- 阳性:内标和CC-2序列均扩增(Ct ≤ 36)。
- 阴性:仅内标扩增,或内标未扩增(无玉米DNA)。
- 含量高低:ΔΔCt ≤ -0.4为“≥质控品”;ΔΔCt > 0.4为“<质控品”。
- 检出限(LOD):0.05%(20拷贝/反应)。
五、方法二:实时荧光PCR定量检测
1. 原理
通过标准曲线计算转化体拷贝数与内标基因的比值,定量分析转基因含量。
2. 关键参数
- 校准品制备:纯合转化体DNA梯度稀释(涵盖5个浓度)。
- 标准曲线公式:Ct = a + b·lg(c),要求R² ≥ 0.98,斜率b为-3.1~-3.6。
- 定量计算:
- 拷贝数比值 = (转化体拷贝数均值 / 内标基因拷贝数均值)× 100%。
- 不确定度评定:联合验证数据预评定的标准不确定度(u0=0.0044,ur=0.0384)。
3. 结果判定
- 定量限(LOQ):0.1%(40拷贝/反应)。
- 定量结果表示为“C ± U”(C为均值,U为扩展不确定度)。
六、方法三:普通PCR定性检测
1. 原理
通过普通PCR扩增目标序列,电泳检测产物判断是否存在CC-2转化体。
2. 关键参数
- 引物:
- 内标基因zSSIIb(151 bp):引物zSSIIb-1F/2R。
- CC-2特异性序列(132 bp):引物CC-2-F/R(见附录A.2)。
- 扩增条件:94℃ 5min预变性;94℃ 30s + 58℃ 30s + 72℃ 30s,35循环;72℃延伸7min。
- 电泳检测:1%琼脂糖凝胶,溴化乙锭染色(建议用替代染料)。
3. 结果判定
- 阳性:内标和132 bp条带均出现。
- 阴性:仅内标或无条带。
- 检出限(LOD):0.1%(40拷贝/反应)。
七、附录A(关键序列)
- A.1实时荧光PCR扩增序列:107 bp片段,含玉米基因组(1-40)和外源插入序列(41-107)。
- A.2普通PCR扩增序列:132 bp片段,含玉米基因组(1-91)和外源插入序列(92-132)。
八、安全提示
- 溴化乙锭(EB):具致癌性,操作需戴手套,建议使用替代核酸染料。
九、方法对比与适用场景
方法 | 特点 | 适用场景 |
---|---|---|
实时荧光定性 | 快速、灵敏,可初步定量 | 筛查是否存在转基因成分 |
实时荧光定量 | 精确测定转基因含量 | 需定量标识或阈值判定 |
普通PCR定性 | 成本低,需电泳验证 | 实验室基础检测或验证结果 |
总结:本标准系统规范了耐除草剂玉米CC-2转化体的检测流程,涵盖定性与定量方法,强调质控、校准及结果判定的科学性,适用于市场监管、科研及进出口检验等领域。
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