前 言
为贯彻《中华 外来入侵
物种管 入侵水
生动物调
本 外来入
侵水生动物
本
本 J 为规
范性附录本
本本本本
1 适用范围
3 术语和定义
3.1
3.2
外来水生动物 alien aquatic animals
在我国无天然分布,经直接或间接人为途径传入的水生动物,包括该动物所有可能存活和繁殖的部分、配子或繁殖体。
3.3
外来入侵水生动物 invasive alien aquatic animals
传入定殖并对生态系统 生境 物种带来威胁或者危害 影响我国生态环境 损害农林牧渔业可持续发展
3.4
环境
环境 DNA
的集合 的细胞
或游离
3.5
阳性对照
确 否可靠。
3.6
阴性对照
确 是否被
污染。
3.7
最低检测限
一
3.8
实时荧光 reaction(qPCR)
在 物结合
而释放 模板量进
行定量分
3.9
定量循环
q
3.10
技术重复
对 随机误
差,提高
3.11
引物
在 定长度
和顺序的
4 试剂、
包括
5 目标物种
目标物种依据农业农村部、生态环境部等公开发布的外来入侵物种管理名单确定,并根据最新公开
发布或修编的外来入侵物种名录同步更新,参见附录 B。
6 评估程序
基于环境 体外来入侵水生 布评估 入侵水
生动物采 动物分布 程序见
图 1 基于环境 DNA 的内陆水体外来入侵水生动物调查与分布评估程序
7 资料收集
8.2 采样
表 1 湖库区采样点参考数量
8.2.1.3 水田采样点布设
以田埂为边界将大片水田划分为单块水田 每块水田按五点采样法或随机法布设 ~ 个采样点,采样点
8.2.2
根 物样本。目标物种 可采
集沉积
8.2.3
采样 时间需
满足以
a
b
c
d
e f
8.2.4
8.2.4.1
a
b 该点水
8.2.4.2
8.2.4.3 积推荐
为1 L, 悬浮颗粒物后再
8.2.4.4 积生物残体,
8.3 保存
8.3.1 过滤间
隔不宜
8.3.2 温保存。
保存及
8.3.3 当需要常温保存或运输时,可将滤膜或沉积物样本迅速浸没到附录E推荐的固定剂中,固定剂类
型参见附录E 。保存和运输过程避免阳光直射。
9 外来入侵水生动物分布评估
9.1 环境
9.1.1
水体样
a b
9.1.2
9.1.2.1 多糖、 RNA等
9.1.2.2 L,最
佳质量 280 nm)
应在1.7 符合浓
度和纯 的qPCR检测,
9.2 qPCR
9.2.1
9.2.1.1 50℃~
68℃范围内 构。引
物对中 宜比引物的退火温
9.2.1.2 反应。 9.2.2
每个 确其对
应的 Cq 。
9.2.3
按照
a 液。标
信水平下
Cq 值。
9.3 采样点评估
9.3.1 样本评估结果
按照以下要求明确样本评估结果:
a ) 2 份及以上技术重复检测的 cq值均≤LOD对应的cq值 , 认定该样本为阳性样本, 检出 目标物种成分;
b ) 仅 1 份技术重复检测的 ca值≤op 对应的ca值, 应重新检测该样本。重新检测样本设置 3
个技术重复 , 当 1 份及以上技术重复检测的 cq值≤LOD 对应的 cq值 , 认定该样本为阳性样本, 检出 目标物种成分; 否则 , 认定该样本为阴性样本, 未检出 目标物种成分;
c ) 不符合上述, 认定该样 阴 未检出 成分
9.3.2 采样点评估结果
按照以下要求明确环境DNA采样点评估结果 :
a)同一采样点存在 2 个及以上阳性样本, 该采样点为阳性采样点 ; b , 不符合上述情况, 该采样点为阴性采样点 。
9.4 区域分布评估
9.4.1 确定评估主体
按照以下要求确定评估主体 , 明确区域内阳性采样点数量: a 宜以评段为进行分 ;
b ) 湖泊和水库宜开展整体评估, 河道型或狭长型湖库宜参照河流进行分布评估;
c 田 。
9.4.2 评估主体阳性采样点所占比重测算
评估主体阳性采样点所占比重按照公式 (1) 计算 :
P=(M/NMX100% (1)
式中:P 阳性采样点所占比重 , %;
M 阳性采样点数量;
9.4.3 评估主体分布评估等级划分
评估主体外来入侵水生动物分布评估等级依据P值划分 , 具体如下 :
a ) P值为 0 , 无 ;
b ) P值在 0 - 10%, 零星分布;
c ) P值在 10% (含) 30%, 局部 ;
d ) P值为30% (含) 以上, 广泛分布
10 质量控制与质量保证
10.1 质量控制
10.1.1 环境DNA样本采集过程中以无菌水为阴性对照 , 用于检测采集过程中的污染 。
10.1.2 qpcR检测过程中以等体积己知浓度目标物种DNA为阳性对照 , 同步进行qpcR扩增 。阳性对照样本q pcR检测cq值LOD对应的cq值则可判断整个反应体系和反应过程可靠 。
10.1.3 qpcR检测过程中以无菌水为阴性对照 , 用于排除检测过程中污染造成的假阳性。阴性对照样本qPCR检测>LOD对应的cq值则可判断该过程中受试样本未被污染 .
10.1.4 每个采样点平行采集3个样本, 每个样本qpcR扩增过程设置3个技术重复 , 必要时可增加样本数和技术
10.2 质量保证
10.2.1 环境DNA样本采集前应彻底灭活设备和装置 , 按照附录 I 的规定做好样本采集、采样记录、样
本运输, 防止样本交叉污染。
10.2.2 实验过程应防止样本污染, 按照附录 J 的规定做好环境DNA提取、 cq值确定、 数据记录、样本保存和数据保存。
11 废弃物处理
参照 NT4835 规定执行废弃物的分类 、隔离 、收集、贮存、处理和处置 。生物废弃物在处理之前应采用高压灭菌 、消毒或灼烧等方式灭活。实验过程中产生的废物应集中收集 , 分类保存 , 及时处理,并做好处理记录 。
12 评估告编制
基于环境 DNA 的内陆水体外来入侵水生动物调查与分布评估报告内容包括前言 、评估区域概况、目标物种概述、 采样方法和流程、 分布评估结果、对策与建议等, 评估报告编写格式参见附录 K 。
附 录 A
(资料性附录)
A.1 试剂
A.1.1
除
A.1.2
A.1.2.1
A.1.2.2
A.1.3
推荐使需试剂
A.1.3.1
A.1.3.2
A.1.3.3
A.1.3.4
A.1.3.5适量无A.1.3.6
A.1.3.7
A.1.3.8
A.1.3.9
A.1.3.10溶于适量pH 约
A.1.3.11
A.1.3.12
A.1.3.13 (A.1.3.1 A.1.3.14
A.1.3.15
A.1.3.16
A.1.3.17 阳性对照样品:已知物种组成的基因组 DNA 或人工合成含有目标序列的 DNA 片段的混合物,市售。
A.1.4 PCR 检测试剂
A.1.4.1 特异性引物:外来入侵水生动物环境 扩增引物 可选择 对或多对
A.1.4.2 和 PCR
缓冲液
A.1.4.3 至 1 L, pH=7.8
A.1.4.4
A.1.4.5 包含若干
条单一
A.1.4.6
A.1.4.7
A.2 仪器设
A.2.1
A.2.1.1
A.2.1.2
A.2.1.3
A.2.1.4
A.2.1.5
A.2.1.6 A.2.1.7
A.2.1.8 A.2.2
A.2.2.1
A.2.2.2
A.2.2.3
A.2.2.4
A.2.2.5
A.2.2.6 A.2.2.7
A.2.2.8
A.2.2.9
A.2.2.10
A.2.2.11
A.2.2.12 A.2.2.13 凝胶成像仪:具备 DNA 凝胶成像拍照功能。
附 录 B
(资料性附录)主要外来
附 录 C (资料性附录)
附 录 D
D.1
D.2
(资料性附录)
图 D.2 湖库外来入侵水生动物环境 DNA 采样点布设示意图
附 录 E
(资料性附录)
E.1 乙醇固定剂
附 录 F
(规范性附录)
F.1 序列比
参照
将引物和
选出特异性产物的序
针检测
F.2 实
以
进行 q
与目标序
附 录 G
(资料性附录)
qPCR
实验单DNA 样DNA 样DNA 样
注:琼
附 录 H
(资料性附录)
图 H.1 LOD 在标准曲线中位置示例
注:LOD 的确定应在 qPCR 实验条件优化后进行,包括退火温度、引物/探针浓度等,这些因素都会影响 qPCR 效率;每个标准浓度有足够的重复数才能确保 LOD 数值准确;当将实验转移到新的实验体系时,应重新确定 LOD。
附 录 I
(规范性附录)
附 录 J
(规范性附录)
J.1 实
J.1.1
J.1.2
J.1.3
J.2 基本
J.2.1
J.2.2 枪)应
进行定
J.2.3 。
J.2.4
J.2.5
J.2.6
J.2.7
J.2.8
J.2.9
J.2.10
J.2.11
J.3 环境
J.3.1
J.3.2
J.3.3
J.3.4
J.3.5
J.3.6
J.3.7 冰箱,
若条件
J.4 Cq
J.4.1 标准曲线应具有 R2值接近 1(通常>0.99)。
J.4.2 在分析 Cq 值时,应排除极端值与异常波动值。
J.4.3 Cq 值确定过程中的数据应妥善存储,并按照要求记录保存位置。
J.5 数据记录
详 所有数
据记录的 则数
据应定
J.6 样
J.6.1 。
J.6.2 储存室。
J.6.3
J.7 数
数据
附 录 K
(资料性附录)
K.1 摘
概述
K.2 目
一
K.3 正文
K.3.1
包括
K.3.2
包括
K.3.3
包括
K.3.4
包括
K.3.5
包括
K.3.6
针
K.4 参考
列

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