NY/T 4494-2025 莴苣品种鉴定 SSR分子标记法 ,该文件为pdf格式 ,请用户放心下载!
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本文件规定了利用简单重复序列(SSR)标记进行莴苣(Lactucasativa L?)品种鉴定的操作程序、结
果统计与结果判定.
本文件适用于莴苣品种SSR指纹数据采集、数据库构建和品种鉴定.
2 规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款.其中,注日期的引用文件,
仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文
件.
GB/T3543?2农作物种子检验规程 扦样
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
NY/T2594植物品种鉴定 DNA 分子标记法 总则
3 术语和定义
NY/T2594规定的术语和定义适用于本文件.
4 缩略语
下列缩略语适用于本文件.
APS:过硫酸铵(ammoniumpersulphate)
bp:碱基对(basepair)
CTAB:十六烷基三甲基溴化铵(cetyltrimethylammoniumbromide)
DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid)
dNTPs:脱氧核糖核苷三磷酸(deoxyGribonucleosidetriphosphate)
EDTA:乙二胺四乙酸(ethylenediaminetetraaceticacid)
PAGE:聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamidegelelectrophoresis)
PCR:聚合酶链式反应(polymerasechainreaction)
SSR:简单重复序列(simplesequencerepeat)
Taq 酶:耐热DNA 聚合酶(TaqGDNApolymerase)
Tris:三羟甲基氨基甲烷(Tris(hydroxymethyl)methylaminomethaneTHAM)
TE:三羟甲基氨基甲烷乙二胺四乙酸(TrisGEDTA)
TBE:三羟甲基氨基甲烷硼酸盐乙二胺四乙酸(TrisGborateGEDTA)
TEMED:四甲基乙二胺(N,N,N′,N′Gtetramethylethylenediamine)
5 原理
不同莴苣品种基因组中SSR的重复次数存在差异,这种差异可通过PCR扩增及电泳方法进行检测,
进而区分不同的莴苣品种.
6 主要仪器设备及试剂
主要仪器设备及试剂见附录A.
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7 溶液配制
溶液配制方法见附录B.
8 引物相关信息
引物名单及序列见附录C,引物相关信息见附录D.
9 参照品种
参照品种相关信息见附录E.
10 操作程序
10?1
样品准备
送检样品可为种子、幼苗、叶片等组织或器官.样品需扦样时,应符合GB/T3543?2的要求.每份样
品取不少于30个个体的叶片或其他等效物,混合分析,必要时进行个体检测.
10?2
DNA 提取
取幼苗或叶片200mg~300mg,置于2?0mL离心管,加液氮充分研磨;每管加入600μL经65℃预
热的CTAB提取液,充分混合,65℃水浴45min~60min,其间多次轻缓颠倒混匀.每管加入与CTAB
提取液等体积的三氯甲烷和异戊醇混合液,轻缓混匀后静置10min,在12000r/min离心10min.吸取
上清液转移至新的离心管中,加入等体积预冷的异丙醇,轻轻颠倒混匀,-20 ℃放置30 min,4 ℃、
12000r/min离心10min.弃上清液,用体积分数为70%的乙醇溶液洗涤2遍,晾干,加入100μL双蒸
水或TE缓冲液充分溶解,检测DNA 浓度后4℃备用.
注1:以上为推荐的DNA提取方法,DNA质量能够满足PCR扩增要求的其他DNA提取方法均适用.DNA溶液的紫
外吸光度OD260与OD280的比值宜介于1?7~2?0.
注2:三氯甲烷和异戊醇混合液中三氯甲烷与异戊醇的体积比为24∶1.
10?3
PCR 扩增
10?3?1 反应体系
PCR扩增反应体系的总体积和各组分的终浓度参照表1配制,可以依据试验条件调整.表1中的缓
冲液若含有氯化镁(MgCl2),不再加MgCl2溶液,加等体积双蒸水替代.利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳
(PAGE)检测时选择普通引物;利用荧光毛细管电泳检测时选择荧光标记引物,荧光标记位于上游引物5′
端,推荐的荧光标记见附录D.
表1 PCR 扩增反应体系
反应组分原浓度终浓度推荐加样体积,μL
10×缓冲液(含MgCl2) 10× 1× 2?0
dNTPs 10mmol/L 0?1mmol/L 0?2
Taq 酶5U/μL 0?05U/μL 0?2
上游引物10μmol/L 0?25mmol/L 0?5
下游引物10μmol/L 0?25mmol/L 0?5
DNA 50ng/μL 5ng/μL 2?0
双蒸水— — 14?6
总体积20?0
10?3?2 反应程序
推荐反应程序为:95℃预变性5min;95℃变性30s,57℃退火30s,72℃延伸1min,共35个循环;
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72℃延伸10min,产物4℃保存.反应程序中各反应参数可根据PCR扩增仪型号、酶、引物等不同而做
适当的调整.
10?4
PCR 产物检测
10?4?1 变性PAGE
10?4?1?1 制胶
用洗涤剂将玻璃板清洗干净,再用双蒸水、无水乙醇分别擦洗2遍.玻璃板干燥后,将0?5mL亲和
硅烷工作液均匀涂在长玻璃板上,将0?5mL剥离硅烷工作液均匀涂在带凹槽的短玻璃板上.操作过程
中防止2块玻璃板互相污染.玻璃板彻底干燥后,将0?4mm 厚的塑料隔条整齐放在长玻璃板两侧,盖上
凹槽短玻璃板,用夹子固定,用水平仪检查玻璃胶室是否水平.配制8%PAGE胶,取26?7mL质量分数
为30%的PAGE胶溶液,加入62?5mL蒸馏水、50μL四甲基乙二胺(TEMED)和550μL质量分数为10%的
过硫酸铵(APS),迅速混匀,将胶灌入玻璃胶室,灌胶过程中防止出现气泡.待胶室灌满后,在凹槽处将
0?4mm 厚鲨鱼齿梳子平齐端向里轻轻插入胶液约4mm.室温聚合1h以上.胶聚合后,清理胶板表面
溢出的胶液,轻轻拔出梳子,用水清洗干净备用.
注:为保证检测结果的准确性,建议玻璃板的规格为45cm×35cm.
10?4?1?2 变性
在20μLPCR产物中加入4μL6×加样缓冲液,混匀.在PCR仪上运行95℃变性5min,取出立即
置于冰上,冷却10min以上备用.
10?4?1?3 电泳
将胶板安装于电泳槽上,在电泳正极槽(下槽)加入600mL的1×TBE缓冲液,负极槽(上槽)加入
600mL经的1×TBE缓冲液,使其超过凝胶顶部约3cm.80W 恒功率预电泳10min~20min.用移液
器吹吸加样槽,清除气泡和杂质.将样品梳(鲨鱼齿朝下)插入凝胶1mm~2mm.每一个加样孔点入
3μL~5μL样品.除送检样品外,还应同时加入参照品种扩增产物.80W 恒功率电泳,电泳时间参考二
甲苯青指示带移动的位置和扩增产物预期片段大小范围(见附录D)加以确定.二甲苯青指示带在8%
PAGE胶电泳的移动位置与230bp扩增产物泳动的位置大致相当.扩增产物片段大小在(100±30)bp、
(150±30)bp、(200±30)bp、(250 ± 30)bp范围的,电泳参考时间分别为1?5h、2?0h、2?5h、3?5h.
电泳结束后关闭电源,取下玻璃板并轻轻撬开,通常凝胶附着在长玻璃板上.
10?4?1?4 染色
将附着凝胶的长玻璃板胶面向上浸入固定液中,轻轻晃动3min后取出,在双蒸水中快速漂洗,时间
不超过10s;将胶板放入染色液中,轻轻晃动5min后取出,在双蒸水中快速漂洗,时间不超过10s;将胶板
放入显影液中,轻摇晃动待条带清晰后取出,再迅速放入固定液中定影5min取出,在双蒸水中漂洗1min;
取出胶板,晾干,放在胶片观察灯上观察,记录结果,拍照保存.
注:固定液、染色液、双蒸水和显影液的用量,可依据胶板数量和大小调整,以淹没胶面为准.
10?4?2 荧光毛细管电泳
10?4?2?1 PCR产物样品准备
按照预先确定的引物分组,分别取等体积的同一组中不同荧光引物的扩增产物,混匀稀释.从混合液
中吸取1μL,加入DNA 分析仪专用96孔板中.板中各孔分别加入0?1μL分子量内标和8?9μL去离子
甲酰胺,在PCR仪上95℃变性5min,取出后立即置于冰上,冷却10min以上,瞬时离心10s后备用.
注:引物分组和稀释倍数通过荧光毛细管电泳预实验确定.
10?4?2?2 等位变异检测
打开DNA 分析仪,检查仪器工作状态和试剂状态.将装有样品的96孔上样板放置于样品架基座
上,打开数据收集软件,按照仪器使用手册,编辑样品表,执行运行程序,DNA 分析仪将自动运行,并保存
电泳原始数据.
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10?5 数据分析
10?5?1 数据读取
每个SSR位点的等位变异参照扩增片段大小命名,见附录D.对于变性PAGE,将送检样品在某一
位点扩增片段的迁移位置与对应的参照品种进行比较,确定送检样品在该位点的等位变异.对于荧光毛
细管电泳,通过参照品种消除不同批次间或者不同型号DNA 分析仪间可能存在的系统误差,使用片段分
析软件读取送检样品在该位点的等位变异.
纯合位点的等位变异数据记为X/X,杂合位点的等位变异数据记录为X/Y,其中X、Y 分别为该位点
上的2个等位变异,小片段数据在前,大片段数据在后.缺失位点的等位变异数据记录为0/0.
示例1:样品在某个位点上仅出现1个等位变异,为160bp,则该位点的等位变异数据记录为160/160.
示例2:样品在某个位点上有2个等位变异,分别为160bp、165bp,则该位点的等位变异数据记录为160/165.
10?5?2 数据比对
将送检样品每个位点的等位变异数据逐一比对,按照位点相同、差异、数据缺失、无法判定等情形,记
录每个位点的结果.
11 结果统计
统计比对结果为位点差异的情况,计算差异位点数.
12 结果判定
12?1
判定规则
当品种间差异位点数>2,判定为“不同”;当品种间差异位点数≤2,判定为“疑同”;当品种间差异位
点数≤2,但存在位点数据缺失或无法判定情形时,不做判定.
12?2
结果表述
送检样品与对照样品(或数据库中品种)采用检测平
台,检测位点数为,差异位点数为,判定为.当存在位点数据缺失或无
法判定情形时,应表述具体情况.
示例1:送检样品A与对照样品B采用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测平台,检测位点数为22,差异位点数为2,判定为
疑同.
示例2:送检样品A与对照样品B采用荧光毛细管电泳检测平台,检测位点数为22,差异位点数为1,送检样品在
WSULs159位点数据缺失.
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附 录 A
(规范性)
主要仪器设备及试剂
A?1 主要仪器设备
A?1?1 PCR扩增仪.
A?1?2 高压电泳仪:最高电压不低于2000V,具有恒电压、恒电流和恒功率功能.
A?1?3 垂直电泳槽及配套的制胶附件.
A?1?4 离心机.
A?1?5 水平摇床.
A?1?6 胶片观察灯.
A?1?7 电子天平:感量为0?1g和0?01g.
A?1?8 微量移液器:规格分别为10μL、20μL、100μL、200μL、1000μL,连续可调.
A?1?9 磁力搅拌器.
A?1?10 核酸浓度测定仪或超微量紫外分光光度计.
A?1?11 微波炉.
A?1?12 高压灭菌锅.
A?1?13 酸度计.
A?1?14 水浴锅.
A?1?15 低温冰箱.
A?1?16 制冰机.
A?1?17 凝胶成像系统或紫外透射仪.
A?1?18 DNA 分析仪:基于毛细管电泳,有片段分析功能和数据分析软件,最低区分力1bp.
A?1?19 其他相关仪器和设备.
A?2 主要试剂
除非另有说明,在分析中均使用分析纯试剂.
A?2?1 十六烷基三甲基溴化铵[CTAB,C16H33(CH3)3NBr,CAS号:57G09G0].
A?2?2 三氯甲烷(CHCl3,CAS号:67G66G3).
A?2?3 异戊醇(C5H12O,CAS号:123G51G3).
A?2?4 异丙醇[(CH3)2CHOH,CAS号:67G63G0].
A?2?5 乙二胺四乙酸二钠(EDTAGNa,C10H14N2Na2O8,CAS号:139G33G3).
A?2?6 三羟甲基氨基甲烷(Tris,C4H11NO3,CAS号:77G86G1).
A?2?7 浓盐酸(HCl,CAS号:7647G01G0).
A?2?8 氢氧化钠(NaOH,CAS号:1310G73G2).
A?2?9 10×PCR缓冲液:含Mg2+25mmol/L.
A?2?10 4种脱氧核糖核苷酸:dATP、dTTP、dGTP、dCTP.
A?2?11 氯化钠(NaCl,CAS号:7647G14G5).
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A?2?12 Taq DNA 聚合酶(Taq 酶,CAS号:9012G90G2).
A?2?13 DNA Marker:DNA 片段分布范围在50bp~500bp.
A?2?14 甲酰胺(CH3NO,CAS号:75G12G7).
A?2?15 溴酚蓝(C19H10Br4O5S,CAS号:115G39G9).
A?2?16 二甲苯青(C25H27N2NaO6S2,CAS号:2650G17G1).
A?2?17 甲叉双丙烯酰胺[(H2C=CHCONH)2CH2,CAS号:110G26G9].
A?2?18 丙烯酰胺(C3H5NO,CAS号:79G06G1).
A?2?19 硼酸(H3BO3,CAS号:10043G35G3).
A?2?20 尿素(CH4N2O,CAS号:57G13G6).
A?2?21 亲和硅烷.
A?2?22 剥离硅烷.
A?2?23 无水乙醇(C2H6O,CAS号:64G17G5).
A?2?24 四甲基乙二胺(TEMED,C6H16N2,CAS号:110G18G9).
A?2?25 过硫酸铵[APS,(NH4)2S2O8,CAS号:7727G54G0].
A?2?26 冰醋酸(CH3COOH,CAS号:64G19G7).
A?2?27 硝酸银(AgNO3,CAS号:7761G88G8).
A?2?28 甲醛(HCHO,CAS号:50G00G0).
A?2?29 DNA 分析仪用丙烯酰胺胶液.
A?2?30 DNA 分析仪用分子量内标.
A?2?31 DNA 分析仪用电泳缓冲液.
A?2?32 DNA 分析仪用光谱校准基质.
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附 录 B
(规范性)
溶液配制
试剂配制用水需符合GB/T6682的要求.
B?1 DNA 提取溶液的配制
B?1?1 0?5mol/LEDTA 溶液
称取186?1gNa2EDTA?2H2O,溶于800mL水中,充分搅拌溶解,加NaOH 调pH 至8?0,加水定
容至1000mL,121℃高压灭菌20min.
B?1?2 0?5mol/LHCl溶液
量取25mL浓盐酸(质量分数为36% ~38%),加水定容至500mL.
B?1?3 1mol/LNaOH 溶液
称取40?0gNaOH,溶于800mL水中,充分搅拌溶解,加水定容至1000mL.
B?1?4 1mol/LTrisGHCl溶液
称取121?1gTris碱,溶于800mL 水中,充分搅拌溶解,加HCl调pH 至8?0,加水定容至1000
mL,121℃高压灭菌20min.
B?1?5 CTAB提取液
称取20?0gCTAB、81?7gNaCl置于1000mL烧杯中,量取100mL1mol/LTrisGHCl溶液和40mL
0?5mol/LEDTA 溶液倒入烧杯中,加700mL水,充分搅拌溶解,加水定容至1000mL,121℃高压灭菌
20min.
B?1?6 TE缓冲液
量取5mL1mol/LTrisGHCl溶液和1mL0?5mol/LEDTA 溶液,加水定容至500mL,121℃高压
灭菌20min,4℃保存.
B?2 PCR 扩增试剂的配制
B?2?1 dNTP溶液
分别配制dATP、dTTP、dCTP、dGTP终浓度为100mmol/L的储存液.各取20μL混合,加120μL
TE缓冲液定容,配制成每种脱氧核糖核苷酸终浓度为10mmol/L的工作液,121℃高压灭菌20min,-
20℃保存.
B?2?2 SSR 引物溶液
开盖前瞬时离心10s,按照说明书加TE缓冲液分别配制正向引物和反向引物终浓度为100μmol/L
的储存液,取10μL储存液,加90μLTE缓冲液配制成终浓度10μmol/L的工作液.
B?3 变性PAGE试剂的配制
B?3?1 质量分数为30%PAGE胶溶液
称取290?0g丙烯酰胺和10?0g甲叉双丙烯酰胺,溶于800mL水中,充分搅拌溶解,加水定容至1000
mL,置于棕色瓶中,4℃储存.
B?3?2 亲和硅烷缓冲液
分别量取99?5mL无水乙醇和500μL冰醋酸,混匀.
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B?3?3 亲和硅烷工作液
分别量取1mL亲和硅烷缓冲液和5μL亲和硅烷原液,混匀.
B?3?4 剥离硅烷工作液
分别量取98mL氯仿溶液和2mL二甲基二氯硅烷溶液,混匀.
B?3?5 质量分数为10%的APS溶液
称取1?0g过硫酸铵,溶于10mL去离子水中,混匀,于4℃保存(不超过5d).
B?3?6 10×TBE缓冲液
称取Tris108?0g、硼酸55?0g,溶于800mL水中,加入37mLEDTA 溶液(0?5mol/L,pH8?0),定
容至1000mL.
B?3?7 1×TBE缓冲液
量取50mL10×TBE缓冲液,加水定容至500mL,混匀.
B?3?8 6×加样缓冲液
分别称取0?25g溴酚蓝和0?25g二甲苯青,加入98mL去离子甲酰胺和2mLEDTA 溶液(0?5mol/L,
pH8?0),搅拌溶解.
B?4 银染溶液的配制
B?4?1 固定液
量取100mL冰醋酸,加水定容至1000mL.
B?4?2 染色液
称取1?0g硝酸银,加水定容至1000mL.
B?4?3 显影液
称取10?0g氢氧化钠,溶于1000mL水中,用前加2mL甲醛.
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NY/T4494—2025
附 录 C
(规范性)
引物名单及序列
引物名单及序列见表C?1.
表C?1 引物名单及序列
引物
编号
引物名称
参考
文献
所在
染色体
上游引物序列(5′→3′) 下游引物序列(5′→3′)
WJ01 WSULs159 [4] Chr1 GGACTTCACTAGTCGACGACATC GCTTGTCTTTCCAACCCAAAAG
WJ02 WSULs153 [4] Chr2 ACCGCTCTCACTCTGAGCACAC CAGTTTGTGCTAGCGTTTCACCA
WJ03 LSEG64 [7] Chr2 CTAGTTCTTCTGCTGCTAGG GATAGGATCGGATCGGATTG
WJ04 KSLG92 [1] Chr3 GGTCTCTTTCCTCTGCCCTG TCGCGTTCTGAAGTAGCCAT
WJ05 LSEG56 [7] Chr3 CCTCCATAACCAAAACCTCA ACTTCTTTCGACATGCTTCT
WJ06 SSRG8 [6] Chr3 GTTGTCTCGTCTCGACCAAA GCGTTCTGAAGTAGCCATGG
WJ07 WSULs162 [4] Chr4 TTTCTCGCTTTCTCTCCTTTCC CAAATCTCCACCCCCAAATAGG
WJ08 KSLG32 [1] Chr4 CGGGGAGCATTTAGTGTGTG AATTTGGGGTCCGATTTGAG
WJ09 LSEG83 [7] Chr4 CCGAAAACAGCCTTGCATCT GTATTGTAGCTGACGGTGGC
WJ10 LSSA28G1 [3] Chr4 TTCATCTCTCTCCTCCTTCAGC ATCCCCATTGTCCTCCC
WJ11 LiG1 [2] Chr5 TTTACCTCCCACCACACACA CCGGCGATTCCATTATTGAT
WJ12 LSEG79 [7] Chr5 TTGATACCTCCGCCATCCTC AGCACAGAAAACACACACACA
WJ13 KSLG245 [1] Chr6 CTTCACCTCCGGAATCCTGT GAGGCACGACTGCCATTTAG
WJ14 KSLG97 [1] Chr6 CGCAGAAAAGGGATCAGACA TCAGAGACACTGCAAAAGGGA
WJ15 SH42 [8] Chr6 GCAAGCTAAAGGGCTTTTTGT CAGCCTGGGAATATTTACTCTGA
WJ16 WSULs18 [4] Chr7 GAAGGTGGTGGGTTGCTGTC TGGGCAATTGCAGATTGAGA
WJ17 SSRG15 [6] Chr8 CAGATCAAGCGGGTAACTAA TATCAAGACCCTAAGCGAAC
WJ18 LSSA05 [3] Chr8 AGAACAACGGTAGCTTGTTAAATTG ATCGTCGGTTAATCTTCGTCG
WJ19 LSSA21G1 [3] Chr8 TTGTACCCAGTTGTCCAAACAG CAGATTGTTGCAGATTTCTTCG
WJ20 SMLG002 [5] Chr9 GTGATTGCATGCCAAATGAA TTAGTAGCCCGCATGCTTTT
WJ21 SMLG015 [5] Chr9 TTGAGGAGGGCATTTACGTC GAGGCGTATCTCCAAGGTGT
WJ22 LSEG77 [7] Chr9 TGTCCACAGATCAGCGATGA CTGGACAGTCGGGATCAGAA
注:表中22对引物主要参考文献[1]HongJH,2015;[2]OliyaBK,2018;[3]PatellaA,2019;[4]RiarDS,2011;[5]SimkoI,
2009;[6]WangS,2017;[7]ZhangG W,2016;[8]ZhouH,2019.
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附 录 D
(资料性)
引物相关信息
引物相关信息见表D?1.
表D?1 引物相关信息
引物编号引物名称荧光标记等位变异范围,bp 主要等位变异,bp 参照品种
WJ01 WSULs159 TAMRA 177~202
177 火棍笋
180 R1226
182 香优九号
184 N1175
186 红莴笋1
188 S1240
190 红莴笋2
192 KNV000256
194 耐寒二白皮
196 尖叶莴笋
198 青皮臭
200 L525
202 KAY008
WJ02 WSULs153 HEX 188~218
188 KNV000245
192 N727
194 红福
196 火棍笋
198 红莴笋1
200 耐寒二白皮
202 青皮臭
204 香优九号
206 N1145
208 紫叶莴笋
210 L1043
212 白皮笋
214 S1240
216 KAY008
218 KNV000280
WJ03 LSEG64 TAMRA 151~179 151 耐寒二白皮
WJ03 LSEG64 TAMRA 151~179
153 红莴笋1
155 火棍笋
157 青皮臭
159 红福
161 紫叶莴笋
163 KAY008
167 KNV000241
175 N1145
177 KNV000259
179 KNV000256
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表D?1 (续)
引物编号引物名称荧光标记等位变异范围,bp 主要等位变异,bp 参照品种
WJ04 KSLG92 FAM 169~199
169 N1194
177 N1136
179 红福
185 红莴笋1
187 光叶莴苣
189 青皮臭
191 火棍笋
193 沪优仕
195 尖叶莴笋
197 L1043
199 酱笋
WJ05 LSEG56 FAM 90~136
90 N1194
92 白皮笋
118 L1043
120 N1145
124 沪优仕
126 B200
128 火棍笋
130 青皮臭
132 红莴笋2
134 L1035
136 R1226
WJ06 SSRG8 TAMRA 151~173
151 N1136
153 红福
159 红莴笋1
161 光叶莴苣
163 青皮臭
165 火棍笋
WJ06 SSRG8 TAMRA 151~173
167 N1136
169 KAY008
171 L1043
173 KNV000246
WJ07 WSULs162 ROX 248~270
248 KNV000259
250 L1035
252 紫叶莴笋
254 R1226
256 L489
258 青皮臭
260 火棍笋
262 耐寒二白皮
264 香优九号
266 红福
268 N1145
270 KNV000258
11
NY/T4494—2025
表D?1 (续)
引物编号引物名称荧光标记等位变异范围,bp 主要等位变异,bp 参照品种
WJ08 KSLG32 ROX 201~219
201 火棍笋
207 L525
209 B200
211 青皮臭
213 KNV000285
215 红福
217 R1226
219 SYG9
WJ09 LSEG83 TAMRA 176~222
176 KNV000285
178 S1251
180 KAY008
182 R1226
184 L489
186 B200
188 灰叶莴苣
190 青皮臭
192 火棍笋
WJ09 LSEG83 TAMRA 176~222
194 红莴笋1
196 KNV000286
198 红莴笋2
200 沪优仕
202 KNV000251
204 红福
206 紫叶莴笋
210 KNV000258
212 KNV000258
216 香优九号
218 香优九号
220 白皮香莴笋
222 白皮香莴笋
WJ10 LSSA28G1 FAM 136~182
136 KNV000241
140 KNV000286
141 圆叶白皮笋
142 布莱克柔丝
144 KNV000259
146 N1145
148 四季白尖叶
150 N727
154 KNV000246
156 KNV000280
158 KNV000245
160 KAY008
162 尖叶莴笋
164 红莴笋1
166 紫叶笋
168 L1043
170 青皮臭
172 香优九号
174 火棍笋
176 白皮笋
WJ10 LSSA28G1 FAM 136~182 180 耐寒二白皮
182 S1240
12
NY/T4494—2025
表D?1 (续)
引物编号引物名称荧光标记等位变异范围,bp 主要等位变异,bp 参照品种
WJ11 LiG1 FAM 200~212
200 N1145
203 青皮臭
209 N1194
212 B200
WJ12 LSEG79 ROX 150~204
150 红莴笋2
156 碧霄
158 R1226
160 沪优仕
162 紫叶莴笋
164 青皮臭
166 火棍笋
168 KNV000241
170 光叶莴苣
172 香优九号
174 SYG8
176 KNV000246
178 KAY008
180 B200
182 R752
184 LS15523
192 KNV000252
194 KNV000251
196 沪优仕
200 N1145
202 N1145
204 N745
WJ13 KSLG245 FAM 253~273
253 B200
255 N1145
257 N1136
265 红福
267 沪优仕
269 S1240
271 青皮臭
273 火棍笋
WJ14 KSLG97 HEX 221~233 221 S1240
227 紫叶莴笋
WJ14 KSLG97 HEX 221~233
229 青皮臭
231 KNV000256
233 N1194
WJ15 SH42 TAMRA 265~307
265 沪优仕
268 KNV000283
271 尖叶莴笋
274 L1025
277 沪优仕
280 火棍笋
286 N1136
292 L525
295 KAY008
298 N1175
301 红莴笋1
304 紫叶莴笋
307 青皮臭
13
NY/T4494—2025
表D?1 (续)
引物编号引物名称荧光标记等位变异范围,bp 主要等位变异,bp 参照品种
WJ16 WSULs18 ROX 207~260
207 沪优仕
210 KAY008
233 KNV000258
236 M577
239 紫叶笋
248 沪优仕
254 火棍笋
257 白皮笋
260 尖叶莴笋
WJ17 SSRG15 FAM 137~155
137 N1175
142 尖叶莴笋
144 紫叶笋
147 S1251
149 红莴笋2
151 N1175
153 N727
155 碧霄
WJ18 LSSA05 ROX 249~287
249 KAY008
255 N1175
259 N1175
263 KAY008
267 沪优仕
WJ18 LSSA05 ROX 249~287
269 KNV000245
271 红福
273 青皮臭
275 沪优仕
277 KNV000241
279 紫叶莴笋
281 M1067
283 N727
285 L1043
287 S1251
WJ19 LSSA21G1 HEX 269~331
269 N1194
273 KNV000245
279 R1226
281 S1240
283 青皮臭
285 N1145
287 尖叶莴笋
289 S1251
291 火棍笋
293 酱笋
295 白皮香莴笋
297 沪优仕
299 KNV000256
301 光叶莴苣
303 紫叶笋
305 KNV000259
309 L525
331 L489
14
NY/T4494—2025
表D?1 (续)
引物编号引物名称荧光标记等位变异范围,bp 主要等位变异,bp 参照品种
WJ20 SMLG002 FAM 169~223
169 KNV000286
184 青皮臭
190 N1145
196 灰叶莴苣
199 M1067
202 碧霄
208 沪优仕
211 红莴笋1
214 N727
217 火棍笋
WJ20 SMLG002 FAM 169~223 220 耐寒二白皮
223 红福
WJ21 SMLG015 FAM 240~270
240 沪优仕
245 红福
250 KNV000283
255 沪优仕
260 S1240
265 尖叶莴笋
270 R1226
WJ22 LSEG77 TAMRA 189~213
189 绿叶鲫瓜笋
191 KNV000245
193 KNV000283
195 绿叶鲫瓜笋
197 紫叶莴笋
199 N727
201 N1175
203 R1226
207 S1251
209 SYG9
211 KNV000256
213 KNV000256
注1:附录D中采用的荧光标记仅为示例,采用其他荧光标记类型时,需要用参照品种校正数据.
注2:对于附录D中未包括的等位变异,应按本文件方法,确定其大小和相应参照品种.
注3:附录D中所列参照品种仅为示例,与参照品种具有相同等位变异的其他品种也可用作该等位变异的参照品种.
注4:品种右上角的编号,1———保藏编号为V09F0064,2———保藏编号为V09F0077.
15
NY/T4494—2025
附 录 E
(资料性)
参照品种相关信息
参照品种相关信息见表E?1.
表E?1 参照品种相关信息
编号品种名称/代号品种来源保藏编号编号品种名称/代号品种来源保藏编号
1 LS15523 NCGB XIN31786 29 SYG8 BAAFS —
2 KAY008 NCGB XIN36866 30 SYG9 BAAFS —
3 耐寒二白皮NCGB XIN33825 31 L1043 BAAFS —
4 碧霄NCGB XIN40964 32 S1251 BAAFS —
5 布莱克柔丝NCGB XIN39647 33 L1025 BAAFS —
6 四季白尖叶NCGB XIN33130 34 L1035 BAAFS —
7 火棍笋IVFCAAS V09F0360 35 N1136 BAAFS —
8 红莴笋IVFCAAS V09F0064 36 M577 BAAFS —
9 红莴笋IVFCAAS V09F0077 37 N1175 BAAFS —
10 尖叶莴笋IVFCAAS V09F0190 38 N1145 BAAFS —
11 青皮臭IVFCAAS V09F0216 39 N745 BAAFS —
12 绿叶鲫瓜笋IVFCAAS V09F0130 40 L525 BAAFS —
13 紫叶莴笋IVFCAAS V09F0268 41 N1194 BAAFS —
14 紫叶笋IVFCAAS V09F0120 42 M1067 BAAFS —
15 酱笋IVFCAAS V09F0123 43 N727 BAAFS —
16 白皮笋IVFCAAS V09F0260 44 KNV000241 SAGC —
17 白皮香莴笋IVFCAAS V09F0215 45 KNV000245 SAGC —
18 光叶莴苣IVFCAAS V09F0415 46 KNV000246 SAGC —
19 灰叶莴苣IVFCAAS V09F0392 47 KNV000251 SAGC —
20 圆叶白皮笋IVFCAAS V09F0289 48 KNV000252 SAGC —
21 香优九号SSCNPVTMARA — 49 KNV000256 SAGC —
22 红福SSCNPVTMARA — 50 KNV000258 SAGC —
23 沪优仕SSCNPVTMARA — 51 KNV000259 SAGC —
24 B200 BAAFS — 52 KNV000280 SAGC —
25 R752 BAAFS — 53 KNV000283 SAGC —
26 L489 BAAFS — 54 KNV000285 SAGC —
27 R1226 BAAFS — 55 KNV000286 SAGC —
28 S1240 BAAFS —
注:NCGB为国家作物种质库;IVFCAAS为中国农业科学院蔬菜花卉研究所;SSCNPVTMARA为农业农村部植物新品种测
试(上海)分中心;BAAFS为北京市农林科学院;SAGC为上海市农业生物基因中心.
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