T/CVMA 352-2026 毕氏肠微孢子虫PCR检测方法

文档天下 图书评论3阅读模式

T/CVMA 352—2026

毕氏肠微孢子虫 PCR 检测方法

1 范围

本文件规定了毕氏肠微孢子虫PCR检测方法的材料、操作步骤和结果判定。

本文件适用于动物粪便样品中毕氏肠微孢子虫核酸的检测。

2 规范性引用文件

下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。

GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法

GB 19489 实验室 生物安全通用要求

GB/T 27401 实验室质量控制规范 兽医学检测

3 术语和定义

本文件没有需要界定的术语和定义。

4 缩略语

下列缩略语适用于本文件。

BSL:生物安全防护实验室(biosafety laboratory)

bp:碱基对(base pair)

ddH2O:双蒸水(double-distilled H2O)

DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid)

dNTP:脱氧核糖核苷三磷酸(deoxyribonucleoside triphosphate)

ITS:内转录间隔区(internal transcribed spacer)

PCR:聚合酶链式反应(polymerase chain reaction)

TAE:三羟甲基氨基甲烷-乙酸-乙二胺四乙酸缓冲液(tris aectate-EDTA buffer)

rTaq酶:rTaq DNA聚合酶(rTaq DNA polymerase)

5 主要仪器与设备

5.1 PCR 扩增仪。

5.2 漩涡振荡器。

T/CVMA 352—2026

5.3 台式离心机。

5.4 微量可调移液器及配套吸头(1 μL ~ 2.5 μL,0.5 μL ~ 10 μL,10 μL ~ 100 μL,100 μL ~ 1000 μL)。

5.5 核酸电泳仪。

5.6 核酸电泳槽。

5.7 凝胶成像分析系统。

5.8 高压蒸汽灭菌器。

5.9 生物安全柜或超净台。

6 试剂与耗材

6.1 一次性密封袋。

6.2 EP 离心管(1.5 mL)。

6.3 2.5 %重铬酸钾溶液,按照附录 A 中 A.1 规定的方法配制。

6.4 粪便基因组 DNA 提取试剂盒(市售产品,可选择同类产品替代)。

6.5 PCR 管(200 μL)。

6.6 PCR 扩增试剂盒(市售产品,可选择同类产品替代)。

6.7 1× TAE 缓冲液,按照附录 A.2 和附录A.3 规定的方法配制。

6.8 安全无毒核酸染料。

6.9 配置试剂用水采用蒸馏水或去离子水,PCR 用水按照 GB/T 6682 中一级水的规定执行。

6.10 巢式 PCR 引物。参照毕氏肠微孢子虫 rRNA 基因ITS 位点参考序列(见附录 B),设计巢氏 PCR扩增特异性引物序列,见附录 C 中表 C.1。

6.11 DNA 标准分子质量。

6.12 1 %琼脂糖凝胶,按照附录 A.4 规定的方法配制。

6.13 阳性对照:已经鉴定的毕氏肠微孢子虫 DNA 样品。

6.14 阴性对照:灭菌双蒸水。

7 样品的采集、保存及运送

7.1 样品的采集

应按照 GB/T 27401 的相关要求进行采样。具有掌握相关专业知识和操作技能的工作人员操作,在采集畜禽动物新鲜粪便样本时,对于禽类,可采用棉拭子从其泄殖腔取样;对于哺乳动物,可从直肠进行取样约 10 g 的新鲜粪便于一次性封口袋中。整个采样期间,应佩戴一次性口罩与手套,样本彼此独立,避免交叉污染。每份样本应标记编号、动物种类、年龄、品种、采样时间、采集地点等信息。

T/CVMA 352—2026

7.2 样本的保存与运输

采集的新鲜粪便样品,在2 ℃ ~ 8 ℃的条件下保存应不超过24 h,长期保存需置于2.5 %重铬酸钾溶液中。

长距离运输的样品应先置于密封不透水、防泄漏容器内,再将容器放入具有防压、不透水及防泄漏功能的辅助包装中,最后在周围放置医用冰袋或冷冻制剂,以确保样本维持低温状态。样本应尽快送达检测实验室,最迟不超过72h。

7.3 样本处理的生物安全要求

应按照GB 19489的相关要求,在生物安全2级(BSL-2)实验室中进行检测工作,检测后的样品的处理应按照GB/T 27401中有关规定进行处理。

8 操作方法

8.1 DNA 制备

8.1.1 使用商品化粪便 DNA 提取试剂盒,从粪便样品中提取病原 DNA,按照试剂盒说明书进行操作,确保提取 DNA 的质量与纯度。

8.1.2 提取的 DNA 样品,应立即进行 PCR 扩增。若当前无法进行试验,可存放至-20℃条件下保存。

8.2 PCR 检测

8.2.1 巢氏 PCR 反应体系与扩增程序

8.2.1.1 第一轮 PCR 反应体系与扩增程序

以提取的 DNA 为模板,将所有试剂、引物加入 PCR 反应管,反应体系的配置见附录 D 中表 D.1。第一轮 PCR 扩增反应的反应程序见附录D.2。

8.2.1.2 第二轮 PCR 反应体系与扩增程序

以第一轮扩增产物为模板,将所有试剂、引物加入 PCR 反应管,反应体系的配置见附录 D 中表

D.3 。配置完反应液后应充分震荡混匀并离心之后,进行第二轮扩增。

第二轮 PCR 扩增反应的反应程序见附录D.4。

8.3 PCR 扩增产物琼脂糖凝胶电泳及成像

使用 1× TAE 缓冲溶液配制 1.0 %琼脂糖凝胶,取第二轮 PCR 扩增产物 5 µL ~ 10 µL ,置于 1.0 %琼脂糖凝胶中进行电泳,120 V 电压电泳约30 min,经凝胶成像分析系统成像并观察结果。

9 结果判定

9.1 试验成立条件判定

毕氏肠微孢子虫阳性对照在 392 bp 处,出现相应的特异性条带,阴性对照无扩增条带(见附录 E中图 E.1),判定为试验成立。

9.2 结果描述及判定

T/CVMA 352—2026

9.2.1 阳性

试验成立条件下,被检样品在 392 bp 处出现特异性条带,判定为毕氏肠微孢子虫核酸阳性。如果需要进一步鉴定其序列或基因型,可对 PCR 扩增产物进行测序。

9.2.2 阴性

试验成立条件下,被检样品在 392 bp 处无特异性扩增条带,判定为毕氏肠微孢子虫核酸阴性。

T/CVMA 352—2026

附 录 A

(规范性)

试剂配制方法

A.1 2.5 % 重铬酸钾溶液

称取2.5 g 重铬酸钾,加灭菌蒸馏水溶解,定容至100 mL ,保存于室温。

A.2 50× TAE缓冲液

用800 mL灭菌去离子水溶解,充分混匀后用灭菌去离子水补齐至1000 mL ,常温保存备用。

A.3 1 × TAE使用液

50×TAE贮存液 10 mL

去离子水 490 mL

混匀,常温保存备用。

A.4 1.0 %的琼脂糖凝胶

称取1.0 g琼脂糖粉,放入干净的三角瓶中。加入100 mL的1×TAE缓冲液。摇匀后,将三角瓶放入微波炉中高火加热,使琼脂糖粉完全溶解。加热过程中需要间断取出摇匀,以防溶液暴沸。溶液冷却至60 ℃左右(不烫手但仍温热)时,按体积比1:10,000加入安全无毒核酸染料之后,将其倒入已放置好梳子的制胶模具中。待凝胶完全凝固(约30 min ~ 60 min)后,将梳子轻轻拔出,即可放入电泳槽中使用。

T/CVMA 352—2026

附 录 B

(资料性)

毕氏肠微孢子虫 ITSrRNA 基因 ITS 位点片段基因序列

B.1 毕氏肠微孢子虫rRNA基因ITS位点片段参考序列(GenBank Accession No. PP158573.1)

5´-TAGGGATGAAGAGCTTCGGCTCTGAATATCTATGGCTAGATAAAGTACAAGTCGTAAC AAGGTTTCAGTTGGAGAACCAGCTGAAGGATCATTTTCAGTTTTTGGGGTGTGGGTATCGGAATG TATGGTAGGTGATGTGTGTGTGTATGGGGGATGCCGAGGGGACCAGCGGTGTGGTGGTGTGTGT ATGCGTGAGAGTGTATCTGTAAGGGTGAGGGATGTGGGTGCAACGAGTTGGAGGTGGTTCCATG TGGAATAGTGGGATTGGTACGTGATGGTTGGATGGGGGGATGATGTGTGTATGGGTGAGGAAAA TCGGAGGTTGCGGTGCGAGCGGCAGTAGGGTGCCATCAAGAGGTGTATTTGGAAATATCCCTAA TACAGGATCACTA-3´

注:粗体为引物序列。

T/CVMA 352—2026

附 录 C

(资料性)

毕氏肠微孢子虫巢氏 PCR 扩增特异性引物序列

毕氏肠微孢子虫巢氏PCR的引物的名称与序列见表C.1。

表C.1 毕氏肠微孢子虫巢氏PCR引物序列

注:上下游内引物和外引物工作浓度均为25 μM。

T/CVMA 352—2026

附 录 D

(资料性)

巢氏 PCR 反应

D.1 第一轮PCR反应体系

第一轮 PCR 扩增反应体系见表D.1。

表D.1 第一轮PCR扩增反应体系(25 μL)

D.2 第一轮PCR反应程序

第一轮 PCR 扩增反应程序见表 D.2。

表D.2 第一轮PCR扩增反应程序

D.3 第二轮PCR反应体系

第二轮 PCR 扩增反应体系见表 D.3。

表D.3 第二轮PCR扩增反应体系(25 μL)

T/CVMA 352—2026

D.4 第二轮PCR反应程序

第二轮 PCR 扩增反应程序见表 D.4。

表D.4 第二轮PCR扩增反应程序

T/CVMA 352—2026

附 录 E

(资料性)

毕氏肠微孢子虫 PCR 扩增产物电泳结果示意图

毕氏肠微孢子虫 rRNA 基因ITS 位点 PCR 扩增产物电泳结果示意图见图E.1。

标引序号说明:

M —— DNA Marker; 1-5 —— 被检样品; P —— 阳性对照;

N —— 阴性对照。

图E.1 毕氏肠微孢子虫PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳示意图

资源下载此资源下载价格为5金币立即购买,VIP免费

1.本站大部份文档均属免费,部份收费文档,经过本站分类整理,花了精力和时间,收费文档是为了网站运营成本等费用开支;
2.购买会员(或单次下载)即视为对网站的赞助、打赏,非商业交易行为(不认同此观点请勿支付)请慎重考虑;
3.所有收费文档都真实可靠,为了节约成本,文档在网站前台不做预览,如果付费后,与实际文档不符合,都可以加微信号:pdftj888申请退款;
4.付费下载过程中,如果遇到下载问题,都可以加微信号pdftj888解决;
5.手机支付,尽量选择支付宝支付;
6.如图集或者标准不清楚,在本站找不到您需要的规范和图集,希望增加资料等任何问题,可联系微信号:pdftj888解决;

文档天下
  • 本文由 发表于 2026年3月8日 09:59:30
  • 转载请务必保留本文链接:https://www.998pdf.com/71411.html
匿名

发表评论

匿名网友 填写信息

:?: :razz: :sad: :evil: :!: :smile: :oops: :grin: :eek: :shock: :???: :cool: :lol: :mad: :twisted: :roll: :wink: :idea: :arrow: :neutral: :cry: :mrgreen: