NY/T 2476-2025 大白菜品种鉴定 SSR分子标记法 ,该文件为pdf格式 ,请用户放心下载!
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资源简介
以下是对《NY/T 2476-2025 大白菜品种鉴定 SSR分子标记法》标准核心内容的详细总结：
一、标准概况
- 标准属性
- 中华人民共和国农业行业标准，替代NY/T 2476-2013。
- 归口单位：全国植物新品种测试标准化技术委员会（SAC/TC 277）。
- 起草单位：山东省农业科学院作物研究所、农业农村部科技发展中心。
- 主要修订内容
- 新增13对引物：CRIB1-43、CRIB1-54等（覆盖A1-A10连锁群）。
- 删除13对引物：cnu_m139a、nia_m086a等（涉及A1/A3/A6/A9/A10连锁群）。
- 结构调整及文本优化。
- 适用范围
- 适用于大白菜（Brassica rapa ssp. Pekinensis）品种的DNA分子数据采集与鉴定。
二、技术原理
- SSR标记原理
利用大白菜基因组中简单重复序列（SSR）的重复次数差异，通过PCR扩增和电泳检测片段长度多态性，区分不同品种。
三、关键流程与要求
1. 样品准备
- 样品类型：种子、幼苗、叶片等（种子需按GB/T 3543.2扦样）。
- 样本量：≥30个个体混合分析，必要时单体检。
2. DNA提取（CTAB法）
- 步骤：液氮研磨→65℃ CTAB裂解→氯仿抽提→乙醇沉淀→TE溶解。
- 质量要求：OD₂₆₀/OD₂₈₀=1.7~2.0，浓度≥25 ng/μL。
3. PCR扩增
- 反应体系（25μL）：
组分 终浓度 体积（μL） 10X缓冲液 1X 2.5 dNTPs 0.2 mmol/L 0.625 Taq酶 0.05 U/μL 0.4 引物（正/反） 0.25 μmol/L 各2 DNA模板 2.5 ng/μL 5 ddH₂O - 12.475 - 扩增程序：
94℃ 4min → [94℃ 45s → 65℃→50℃ 45s →72℃ 45s]（15循环）→ [94℃ 45s →50℃ 30s →72℃ 45s]（30循环）→72℃ 10min
4. 电泳检测
- 方法选择：
- 变性PAGE：普通引物，银染显色（附录B.4）。
- 荧光毛细管电泳：荧光标记引物（附录D），需内标校正系统误差。
- 关键参数：
- PAGE胶浓度：6%，电压1800V，电泳时间1.5~3.5h（依片段大小定）。
- 毛细管电泳：按仪器手册操作，引物分组见附录F。
5. 数据分析
- 等位变异判定：
- 纯合位点：记录为
X/X（如257/257）。 - 杂合位点：记录为
X/Y（如181/187）。 - 缺失位点：记录为
0/0。
- 纯合位点：记录为
- 系统误差校正：通过参照品种（附录E）校准片段大小（示例见10.5.1）。
6. 结果判定
- 判定规则：
- 差异位点数 > 2 → 判定为“不同”。
- 差异位点数 ≤ 2 → 判定为“疑同”。
- 结果表述：
送检样品与对照样品采用[检测方法]，检测位点数[ ]，差异位点数[ ]，判定为[不同/疑同]。
四、核心附录内容
附录A：仪器与试剂
- 关键设备：PCR仪、电泳系统（PAGE/毛细管）、离心机、核酸测定仪等。
- 主要试剂：CTAB、dNTPs、SSR引物、丙烯酰胺、荧光染料（FAM/ROX/TAMRA/HEX）等。
附录B：溶液配制
- DNA提取液：CTAB提取液、TE缓冲液（pH 8.0）。
- 电泳相关：40%丙烯酰胺、10×TBE、银染试剂（硝酸银/甲醛显影液）。
附录C：引物序列
- 30对核心引物（如CRIB1-43、nia_m138a等），包含正向/反向序列及连锁群位置。
附录D：引物信息
- 荧光标记：每对引物推荐荧光染料（如CRIB1-43用HEX）。
- 等位变异范围：如nia_m138a为245~261 bp。
- 参照品种：每引物对应参照品种（如nia_m138a的参照为豫早0901、W13-8等）。
附录E：参照品种
- 34个品种（如玉青、津绿-3、福77-105等），来源主要为山东省农科院蔬菜所。
附录F：引物分组（荧光毛细管电泳）
- 3个检测组：
组别 FAM标记引物 ROX标记引物 其他标记引物 1 cnu_m090a等3对 CRIB2-23等2对 CRIB1-43（HEX） 2 CRIB6-3等3对 CRIB10-30等2对 CRIB1-54（HEX） 3 CRIB5-11等4对 cnu_m537a等3对 ENA2（TAMRA）
五、关键注意事项
- 专利声明：部分内容可能涉及专利，标准发布机构不承担识别责任。
- 引物使用：优先使用新增引物（如CRIB系列），删减引物（如cnu_m139a）停用。
- 数据校正：必须通过参照品种消除电泳系统误差。
- 终止条件：检出足够差异位点时可提前终止检测。
总结：该标准系统规范了大白菜SSR分子标记鉴定的全流程，重点更新了引物体系，强化了荧光毛细管电泳的应用，并通过参照品种和分组策略提升检测效率与准确性。判定规则明确（差异位点>2即判定不同），为品种真实性鉴定提供技术依据。
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